Manisa Celal Bayar Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Kalite Yönetim Sistemi Belgesi için ilk kez 2017 yılında Türk Standartları Enstitüsü’ne başvurmuş ve Kalite Yönetim Sistemi Belgesini (TS EN ISO 9001:2015) kullanmaya hak kazanmıştı.
2018 yılından itibaren Türk Standartları Enstitüsü tarafından yapılan denetlemeler sonucunda 3 kez üst üste (2018-2019-2020) belge yenileme ve kullanım hakkı verilen Fen Bilimleri Enstitüsü, 2021 yılı Haziran ayında gerçekleştirilen ayrıntılı belge denetleme ve inceleme sonucunda, Kalite Yönetim Sistemi Belgesini (TS EN ISO 9001:2015) 3 yıllığına (13.07.2021-04.01.2024) yenileme hakkını kazandı.